Texte de l'animation
La fixation d’un antagoniste ou d’un agoniste est suivie de réponses physiologiques qui sont hors du champ de ce cours. Consultez les ouvrages de physiologie et de pharmacologie. Le point qui nous intéresse ici, est le mécanisme de transmission de l’information entre le ou les domaines qui fixent le ligand et le ou les domaines qui effectuent la réponse : fixation à des éléments de réponse génique, récepteur intracellulaire, activation d’une protéine G ou d’une fonction kinase, ouverture ou fermeture d’un canal, par exemple. A titre d’exemple, le récepteur canal au glutamate dont le domaine S1S2 change de conformation lors de la fixation d’un ligand, doit transmettre ce changement à la partie transmembranaire qui doit alors ouvrir une porte, petite boucle intra membranaire. A ce jour, il existe très peu de domaines transmembranaires dont on connaisse la structure au niveau atomique. Seulement deux récepteurs, de photon en l’occurrence, et deux canaux, potassium et calcium, sont connus. Le mécanisme de transmission de l’information qui met sans doute en cause une réorganisation de la partie transmembranaire ne peut donc être abordée que par des voies indirectes : effets de mutations, de couplages, de différents agonistes ou antagonistes, etc