Texte de l'animation

Nous allons maintenant schématiser les réactions enzymatiques. Voici l’enzyme, son site catalytique est matérialisé en jaune. Nous l’incubons en présence d’un excès de substrat : il se lie à l’enzyme, et est transformé en produit. L’enzyme est bien un catalyseur puisque nous la retrouvons intacte à la fin de la réaction. Nous refaisons la même expérience mais cette fois nous ajoutons un inhibiteur total dans le mélange réactionnel. Cet inhibiteur est un analogue structural du substrat et va donc être en compétition avec celui-ci pour se lier sur le site catalytique. La liaison est exclusive, c’est-à-dire que sur l’enzyme se trouve soit S soit I. Lorsque le substrat est lié, il se transforme en produit. Par contre lorsque c’est l’inhibiteur qui occupe le site catalytique, il régénère bien évidemment l’enzyme native et se retrouve lui-même intact: l’inhibiteur ne se lie pas de façon covalente à l’enzyme et n’est pas transformé puisque c’est un effecteur. Nous avons schématisé ici l’inhibition compétitive. Reprenons le schéma réactionnel de la cinétique enzymatique, l’inhibiteur compétitif ne peut se lier que sur l’enzyme libre puisque il n’existe qu’un seul site sur l’enzyme, le site catalytique en l’occurrence. Expérimentalement, c’est l’allure du graphe de Lineweaver-Burk 1/v en fonction de 1/ s, la concentration en inhibiteur étant paramétrique qui nous permettra de visualiser le type d’inhibiteur. Un autre cas limite de l’inhibition totale peut être schématisé ainsi. L’enzyme possède 2 sites: le site catalytique, toujours en jaune, et le site inhibiteur. Mais ce dernier n’est pas accessible immédiatement. Il n’est pas visible ici. Donc I ne peut pas se fixer sur l’enzyme libre. Le substrat se lie au site catalytique et le site effecteur en parme est dévoilé, l’inhibiteur peut alors s’y fixer. En fin de réaction, nous avons soit l’enzyme libre ayant ou non libérer le produit et bien sur le complexe abortif ESI. Nous venons de voir l’inhibition incompétitive ou conditionnelle Au niveau du schéma réactionnel, I ne peut se fixer que sur ES puisque son site n’est accessible qu’à condition que S soit déjà lier sur le site catalytique