Biochimie Structurale et Fonctionnelle - Pascale Bobillo
un substrat et des effecteurs : Activation

Dans ce cas a >1 et très souvent a>>1. Le schéma général est :

Schéma de l'activation

L'expression de la vitesse devient (en remplaçant F par A, puisqu'il s'agit d'un activateur) :

Expression de la vitesse en présence d'un activateur

Dans laquelle VM est la vitesse maximale sans activateur.

Les expressions de la VMapp et KMapp sont:

VM apparent
KM apparent

Et en double inverse:

1/v = f (1/ (S) ), (A) parmétrique

si bien que la représentation de Lineweaver Burk est linéaire.

Représentation de Lineweaver-Burk :

1/v = f (1/ (S) ), (A) paramétrique

Conseil

Regardez bien le sens de variation de la concentration en activateur, ce qui vous permet de distinguer l'activation de l'inhibition mixte (modèle d'une inhibition totale).

Les droites convergent en un point de coordonnées :

Coordonnée du point de convergence
Coordonnée du point de convergence

RemarqueGraphes secondaires:

Aucun des paramètres des droites ne sera linéarisable.

Méthode

Pour arriver à extraire les constantes d'activation ainsi que a, il faut d'abord tracer les graphes VMapp et KMapp en fonction de ( A). Ces graphes ne sont pas linéaire.

VM apparent en fonction de (A)
KM apparent en fonction de (A)

Il faut ensuite calculer les dérivées des fonction par rapport à (A);

avec d(u / v) = [ v.du - u.dv] / v 2.

Puis calculez la limite de ces dérivées lorsque (A) tend vers 0. C'est en fait la tangente à l'origine.

Puis il faut déterminer la limite de chaque fonction lorsque (A) tend vers l'infini: ici c'est l'asymptote à la courbe. Voici les résultats:

VM apparent = f ( (A) )
KM apparent = f ( (A) )

On peut de nouveau distinguer des cas limites.

Premier cas limite :

KA = K'A

Schéma de l'activation

Remarque

Il s'agit d'une liaison indépendante des deux ligands sur leurs sites respectifs.

On a alors :

1/v = f (1/ (S) ), (A) parmétrique
VM apparent
KM apparent

RemarqueGraphe de Lineweaver-Burk

Le graphe ressemble à celui que l'on obtenait avec une inhibition non compétitive sauf que l'ordre des différentes droites est inverse du précédent (1/v diminue quand (A) augmente).

Deuxième cas limite

KA est infini

Schéma de l'activation

Remarque

Il s'agit d'un activateur conditionnel, qui ne se fixe que quand le substrat est déjà en place.

 Dans ce cas :

1/v = f (1/ (S) ), (A) parmétrique
VM apparent
KM apparent